TY -的非盟- Fu,易盟——赵,霁AU - Chen PY - 2018 DA -治国2018/12/04 TI -洞察Protein-Ligand相互作用的分子机制:分子对接和分子动力学模拟的寡肽结合蛋白SP - 3502514六世- 2018 AB - Protein-Ligand交互是一个必要的信号转导的先决条件,免疫反应和基因调控。Protein-ligand相互作用的研究是很重要的对于理解生物调节机制,为设计提供理论依据和新发现的药物靶点。在这项研究中,我们分析了分子的相互作用protein-ligand停靠的AutoDock 4.2软件。在AutoDock 4.2软件中,我们使用一种新的搜索算法,混合随机漂移粒子群优化算法和局部搜索(LRDPSO),经典和拉马克的遗传算法(LGA)作为能源优化算法。每个对接算法受到最好的构象分子动力学(MD)模拟来进一步分析protein-ligand相互作用的分子机制。在这里,我们分析蛋白质受体和配体之间的结合能,盐的交互对接地区的桥梁和氢键,在复杂的演变和结构性变化。我们比较这些复合物protein-ligand强调差异之间的相互作用的两个对接方法。它还表明,盐桥和氢键相互作用在protein-ligand稳定起到至关重要的作用。目前的工作重点是提取对接的确定性特征相互作用的动态属性,这是很重要的对于理解生物功能和确定哪些氨基酸残基对接互动是至关重要的。SN - 1748 - 670 - 2018/3502514 / 10.1155 x你——https://doi.org/10.1155/2018/3502514——摩根富林明——计算和数学方法在医学PB - Hindawi KW - ER