TY-JOURA2-FantacciAU - Huang, Po-Jung AU - Chang, Jui-Huan AU - Lin, Hou-Hsien AU - Li, Yu-Xuan AU - Lee, Chi-Ching AU - Su, Chung-Tsai AU - Li, Yun-Lung AU - Chang, Ming-Tai AU - Weng, Sid AU - Cheng, Wei-Hung AU - Chiu, Cheng-Hsun AU - Tang, Petrus PY - 2020 DA - 2020/09/01 TI - DeepVariant-on-Spark: Small-Scale Genome Analysis Using a Cloud-Based Computing Framework SP - 7231205 VL - 2020 AB - Although sequencing a human genome has become affordable, identifying genetic variants from whole-genome sequence data is still a hurdle for researchers without adequate computing equipment or bioinformatics support.GATK金标准识别基因变异法并多年来广泛用于基因组项目和人口基因研究一直到谷歌脑团队开发出新方法深变换法 利用深神经网络构建图像分类模型识别遗传变异高精度深变换成本计算强度,主要约束应用并加速深变管道处理令广电广电广市Google云平台部署深电广电广电用户可以在20分钟内部署DepVariant点播GCP并开始分析至少十大全机顺序数据集,使用GCP免费信用深入Varaint对spark免费使用云计算框架进行小型基因分析,该框架适合实验测试或初步研究,同时保留大规模测序项目的灵活性和可扩缩性。SN-1748-670XUR-https://doi.org/101155/207231205DO-10.1155/2020723205JF-PB计算数学方法HindawiKW-ER