疾病标志物

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荟萃分析:lncRNA GAS5,MEG3和PCAT-1基因多态性与癌症风险之间的关联

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杂志简介

疾病标志物出版有关的疾病标志物,它们的作用和机理的阐明,以及它们在疾病预测,诊断和治疗应用的身份证。

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研究论文

等离子的比较蛋白质组学研究揭示了潜在的新的生物标记组为急性主动脉夹层

急性主动脉夹层(AAD)是一种灾难性的心血管疾病的高致残率和死亡率由于多个致命的并发症。然而,血清蛋白质组的AAD后的分子变化也不是很清楚。在这里,我们用于相对和绝对quantitation-(iTRAQ-)为基础的比较蛋白质组学分析通过从20名AAD患者和20个控制收集的血浆样品进行调查后AAD蛋白质组简档的变化进行同量异序标记。出345克鉴定的蛋白质,266被认为是高品质的量化的蛋白质( 其中25个蛋白积累和12 AAD样品中降低。基因本体论的富集分析表明,25 AAD-积累蛋白质在高密度脂蛋白的细胞成分类别和蛋白质同二聚化的酸性的结果的分子功能类别颗粒富集。蛋白 - 蛋白相互作用网络分析表明,血清淀粉样蛋白A蛋白(萨斯),补体成分的蛋白质,和羧Ñ催化链蛋白质(CPNS)所具有的网络的关键节点。六个选定AAD-积累的蛋白质的表达水平,B2-GP1,CPN1,F9,LBP,SAA1和SAA2,通过ELISA验证。此外,ROC分析表明,B2-GP1和CPN1的的AUC分别为0.808和0.702。我们的数据提供深入的分子变化曲线在AAD后蛋白质水平,并指示该AAD B2-GP1和CPN1是潜在的生物标志物。

研究论文

载脂蛋白E基因多态性,糖化血红蛋白和外周动脉疾病的风险在中国2型糖尿病患者

背景。载脂蛋白E(载脂蛋白E)基因多态性已被发现影响血浆脂质浓度,以及与外周动脉疾病(PAD)的相关性进行了研究。但是,目前还不清楚是否ApoE基因在中国2型糖尿病(T2DM)患者PAD相关。因此,我们的研究旨在调查中国T2DM患者中载脂蛋白E基因多态性与PAD之间的关系。方法。共有192名T2DM患者被分为两组:2型糖尿病糖尿病有PAD。获得的临床和生化参数。聚合酶链反应被用来确定ApoE基因的基因型。多因素Logistic回归分析来确定PAD可能的危险因素。结果。有在基因型的2型糖尿病糖尿病有PAD组间无显著差异和ApoE的等位基因频率。然而,随着PAD组的2型糖尿病往往有更多的ε4 /ε3种基因型(21.5%对11.3%)比T2DM组。多因素Logistic回归分析显示,吸烟,年龄,病程,TG,LDL,与HbA1c是对PAD的危险因素。结论。这些结果表明,没有ApoE和PAD之间的关系的证据。

评论文章

肝包膜下流动作为一个重要的诊断标记物为胆道闭锁的Meta分析

目标。越来越多的证据表明,肝包膜下流动(HSF)可以作为胆道闭锁(BA)的早期诊断的非侵入性超声标记物。然而,关于它的诊断准确结果不一致且没有定论。我们以目标系统评估HSF的预测BA的诊断价值进行了荟萃分析。方法。一个全面的文献检索的四个数据库中进行,以确定符合条件的研究。所有分析均采用STATA 12.0进行。结果。从包含368例和469个控件八条九个研究,包括在我们的荟萃分析。简言之,对于合并的灵敏性,特异性,阳性似然比(PLR),阴性似然比(NLR),诊断比值比(DOR)和曲线下面积(AUC)的值分别为0.95(95%CI 0.88-0.98),0.92(95%CI 0.85-0.96),11.6(95%CI 6.3-21.5),0.06(95%CI 0.02-0.14),201(95%CI 59-689),和0.98(95%CI 0.96-0.99), 分别。此外,与基于各种协变量的亚组分析沿偏回归显示异质性的潜在来源和在每个子组中详述的诊断价值。结论。我们的荟萃分析表明,HSF检测可以预测BA患者和非BA个人提供高精确度。然而,需要有更好的设计和更大的样本量进一步研究,以支持本研究的结果。

研究论文

在肾细胞癌的预测预后的17基因签名

肾细胞癌(RCC),这是泌尿系统最常见的恶性肿瘤之一,近年来已逐渐增加发病率和死亡率。虽然显著的进步已经在RCC的发病分子和生物学研究取得,有效的治疗和预后指标仍然缺乏。为了更好地预测肾癌的预后,我们确定了与癌症基因组图谱(TCGA)数据集RCC患者的总生存期(OS)相关和17个基因标记开发17个基因。通过SurvExpress,我们分析了17个基因的表达差异及其与肾细胞癌患者的五年数据集(赵,TCGA,KIPAN,KIRC和KIRP),然后生存评估的17种基因标记的生存预后相关性为RCC。我们的研究结果表明,17个基因的信号已经不仅在单病理性RCC,而且在多种病理类型RCC的预测预后价值。总之,17个基因的信号模型与RCC患者的生存期,并可能有助于预测有显著的临床意义的预后。

研究论文

一种克氏锥虫基因组串联重复卫星DNA序列作为分子标记的LAMP检测对诊断恰加斯病

南美锥虫病是一种被忽视的热带疾病引起的克氏锥虫这是整个拉丁美洲流行,并通过世界各地的移民传播。诊断目前仅限于具有关于它们的灵敏度和特异性血清学变化和分子技术。这项工作的目的是开发的环介导等温扩增为基础检测新的敏感,适用和成本效益的分子诊断技术克氏锥虫(TC-LAMP)。The results led to determining a highly homologous satellite repeat region (231 bp) among parasite strains as a molecular marker for diagnosing the disease. Tc-LAMP was performed correctly for detecting parasite DNA (5 fg for the CL Brener strain and 50 fg for the DM28, TcVI, and TcI strains). Assay results proved negative for DNA from 16 helminth species and 7 protozoa, including利什曼虫属。TC-LAMP基于高度重复克氏锥虫因此卫星区域被提出作为用于诊断的重要替代品克氏锥虫感染,克服了其他方法限制,例如他们的分析能力,速度,需要专门的设备和训练有素的人员。TC-LAMP能够在资源有限的地区很容易适用于床边血糖检测。

研究论文

泛癌症研究基于33种癌症类型和13285例:在lncRNA CCAT2的综合开发

lncRNA CCAT2表达水平是否影响肿瘤患者的临床进展及预后,目前尚未完全阐明。关于CCAT2表达与临床病理因素(包括生存数据)的相关性,目前仍存在不一致的观点。此外,CCAT2在人类癌症中的调控机制尚不清楚。我们的研究分析了大量的发表数据和TCGA数据库,以确定CCAT2表达与临床病理因素的关系,并探讨其在人类癌症中的调控机制。我们设计了一个全面的研究,以确定的表达在人类癌症CCAT2 TCGA 20所选研究设计一个荟萃分析和数据库,使用StataSE 12.0探索CCAT2表达式之间的关系和33个癌症的预后和临床病理的功能类型和13285名肿瘤患者。此外,我们对从GEPIA和LncRNA2Target V2.0收集的CCAT2的潜在靶基因进行GO和KEGG途径富集分析。肿瘤组织中CCAT2的表达水平高于配对正常组织,与癌症患者预后不良有显著关系。此外,CCAT2过表达与肿瘤大小、临床分期、TNM分级均有显著相关性。与此同时,CCAT2在人类癌症II期表达最高,其次是III期。最后,111个验证的靶基因符号被鉴定出来,GO和KEGG证实了CCAT2验证靶基因在多种途径中显著富集,包括癌途径中的microRNAs。 In summary, CCAT2 can be a potential biomarker associated with the progression and prognosis of human cancer.

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