TY -的A2 Malaguarnera米歇尔AU -杨,光大AU -剑,Liumeng AU -林,Xiangan盟——朱Aiyu AU -温,国华PY - 2019 DA - 2019/12/20 TI -潜在的关键基因的生物信息学分析Trastuzumab-Resistant胃癌SP - 1372571六世- 2019 AB -
背景。本研究进行了识别与获得性耐曲妥珠单抗胃癌相关基因(GC)和分析他们的预后价值。
方法。的基因表达谱GSE77346从基因表达综合下载(GEO)数据库。差异表达基因(度)是通过使用GEO2R。功能和通路富集分析通过使用基因本体论(去)和《京都议定书》百科全书的基因和基因组(KEGG)。检索的搜索工具相互作用的基因(字符串),Cytoscape, MCODE被用于构建蛋白质相互作用(PPI)网络和识别中心的基因。最后,中心基因和总生存期(OS)之间的关系进行了分析通过使用在线kaplan meier绘图机工具。
结果。总共327度被筛选,主要是丰富相关通路在癌症而言,信号通路调节干细胞多能性,HTLV-I感染,ECM-receptor交互。PPI网络构建,18个中心基因(包括一个调节基因和17个表达下调基因)被确定基于PPI网络的度和MCODE分数。最后,四个中心基因的表达(ERBB2, VIM, EGR1 PSMB8)被发现与HER2阳性的预后(HER2 +)胃癌。然而,其他中心的预后价值基因是有争议的;有趣的是,大部分的这些基因干扰素(IFN)刺激基因(isg)。
结论。总的来说,我们建议这四个中心基因可能潜在目标trastuzumab-resistant胃癌,isg可能扮演一个关键的角色在促进曲妥珠单抗阻力在GC。SN - 0278 - 0240 UR - https://doi.org/10.1155/2019/1372571 - 10.1155 / 2019/1372571摩根富林明疾病标记PB - Hindawi KW - ER