ty -jour a2 -shi,mingjun au -hu,maolin au -xie,jiangling au -hou -hou,huiming au -liu -liu,ming au -wang,wang,jianye py -2020 da -2020/07/11 ti-- 透明细胞肾细胞癌中的驱动基因:一项基于甲基化和转录组分析的研究SP -8817652 VL -2020 AB-
背景。以前很少有研究全面探索了CCRCC中DNA甲基化和基因表达的水平。这项研究的目的是确定关键的透明细胞肾细胞癌 - (CCRCC-)相关的DNA甲基化驱动基因(MDG),并基于DNA甲基化水平构建预后模型。
方法。RNA-SEQ转录组数据和DNA甲基化数据是从癌症基因组图集获得的。基于甲基混合算法,我们获得了与CCRCS相关的MDG。使用单变量和多元COX回归分析来研究患者总生存期与每个MDG的甲基化水平之间的相关性。最后,基于从多元COX回归模型得出的回归系数的线性组合建立了预后风险评分(
β
)乘以基因的甲基化水平。
结果。确定了19个与CCRC相关的MDG。将三个MDG(NCKAP1L,EVI2A和BATF)进一步筛选并集成到预后风险评分模型中,即
风险
分数
=
3.710
*
甲基化
等级
的
NCKAP
1
l
+
-
3.892
*
甲基化
等级
的
evi
2
A
+
-
3.907
*
甲基化
等级
的
BATF
。风险模型独立于常规临床特征作为CCRCC的预后因素(
人力资源
=
1.221
,95%置信区间:1.063–1.402和
p
=
0.005
)。联合存活分析表明,预后基因EVI2A和BATF的基因表达和甲基化水平与预后显着相关。
结论。这项研究为CCRCC DNA甲基化的深入研究提供了重要的生物信息学基础。SN -0278-0240 UR -https://doi.org/10.1155/2020/8817652 do -10.1155/2020/8817652 JF-疾病标记 - 疾病标记PB- Hindawi KW- ER- ER-