TY -的A2 Angeletti西尔维亚AU - Cheng,方非盟-李,羌族非盟-王,金陵盟——曾,方非盟-王,开平盟——张余PY - 2020 DA - 2020/10/21 TI -微分肠道粘膜的识别转录组生物标志物对溃疡性结肠炎的生物信息学分析SP - 8876565六世- 2020 AB - 背景．溃疡性结肠炎(UC)是一种复杂的疾病，在遗传和环境因素的相互作用，影响黏膜稳态，引发不适当的免疫反应。这项研究的目的是识别具有潜在治疗靶点和潜在机制的重要生物标志物。 方法．GSE48958、GSE73661和GSE59071的基因表达谱来自GEO数据库。差异表达基因(DEGs)通过GEO2R工具进行筛选。接下来，应用注释可视化集成发现数据库(Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery, DAVID)对基因本体论(GO)和京都基因基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)路径进行分析。然后，利用检索相互作用基因工具(STRING)的Cytoscape可视化蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)。 结果．共有的DEGs基因共128个，其中86个上调基因富集于细胞外空间、炎症反应调节、趋化因子介导的信号通路、脂多糖反应和细胞增殖，42个下调基因富集于膜整体成分，质膜，顶质膜，共转运体活性和氯离子通道活性的组成部分。KEGG通路分析结果显示，DEGs在细胞因子-细胞因子受体相互作用、TNF信号通路、趋化因子信号通路、百日咳和类风湿性关节炎中特别富集。用Cytotype MCODE筛选了PPI网络的18个中心模块。此外，通过对DAVID的再分析，发现有18个基因在细胞外空间、炎症反应、趋化因子介导的信号通路、TNF信号通路、细胞增殖调控和免疫反应中显著富集。 结论．本研究确定了UC的DEGs、关键靶基因、功能通路和通路分析，可能为UC提供潜在的分子靶点和诊断生物标志物。0278-0240 UR - https://doi.org/10.1155/2020/8876565 DO - 10.1155/2020/8876565 JF -疾病标志物PB - Hindawi KW - ER -