TY - JOUR A2 - cameli, paolo AU - Li, Cheng AU - Wu, zenghong AU - Yuan, Kun PY - 2020 DA - 2020/10/19 TI - autophagy related Signature for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma SP - 8899337 VL - 2020 AB -
背景.头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)是世界上最常见的恶性肿瘤之一,生存率低,生活质量差。自噬相关基因(ATGs)已被报道参与恶性肿瘤的起始和进展。在这里,我们旨在研究自噬相关基因与头颈部鳞状细胞癌患者预后之间的关系。
方法.通过分析来自癌症基因组图谱(TCGA)和人类自噬数据库(HADb)的数据集,我们获得了具有预后价值的ATGs。采用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析自噬差异基因的富集功能。生存曲线分析采用Kaplan-Meier法。建立预后自噬相关基因签名,并验证其独立性。
结果.我们一共获得了529个样品和232个ATGs;进一步,我们鉴定了45个与预后相关的基因,并基于15个基因的风险评分建立了预后自噬特征。根据风险评分将患者分为两组。Kaplan-Meier曲线显示,无论是训练组还是验证组,高危组的生存率均显著低于低危组。ROC曲线显示,风险评分在第3年和第5年AUC值最高,分别为0.703和0.724,高于性别、年龄、TNM分期等其他危险因素。列线图进一步证实了其权重对头颈部鳞状细胞癌患者预后的影响。通过KEGG和GO富集分析,我们发现ATGs通过多种介导途径参与肿瘤的发生和侵袭。我们获得了3个枢纽基因(
MAP1LC3B,
FADD,
LAMP1),并在网上进一步分析了存活曲线、突变、差异表达及其在肿瘤中的作用。
结论.我们发现了一种新的自噬相关标记,可能为HNSCC的治疗和预后提供有前途的生物标记基因。我们需要通过临床应用来验证其预后价值。0278-0240 UR - https://doi.org/10.1155/2020/8899337 DO - 10.1155/2020/8899337 JF -疾病标志物PB - Hindawi KW - ER -