TY - Jour A2 - Pisani,Antonio Au - Chi,Lu-Mei Au - Wang,Li-Ping Au - jiao,Dan Py - 2019Da - 2019/02/05 Ti - 鉴别差异表达基因和与之相关的长度非数性RNAParkinson’s Disease SP - 6078251 VL - 2019 AB -
目标。本研究旨在使用微阵列确定与帕金森病(Pd)相关的差异表达基因(DEGS)和长的非编码RNA(LNCRNA)。
方法。我们从基因表达Omnibus下载了微阵列数据GSE6613,其中包括105个样品。我们选择了72个样品,其包含22个健康控制血液样品和50个PD血液样品,以进行进一步分析。后来,我们使用利马筛选DEG和差异表达的LNCRNA(Delncrnas)并通过基因本体(GO)估计它们的功能。此外,构建了竞争内源性RNA(Cerna)网络,包括MicroRNA,LNCRNA和MRNA,以阐明调节机制。此外,我们在Cerna监管网络中使用MRNA进行了KEGG途径浓缩,并构建了最终网络,包括途径,MRNA,MicroRNA和LNCRNA。
结果。总体而言,我们获得了394次,其中包括207个上调的次数和187名下调的次数,以及7个Delncrnas,其中包括2个上调的Delncrna和5个下调的Delncrnas。胰岛素样生长因子-1受体(IGF1R)在内吞作用途径中大大富集。在Cerna调节网络中,IGF1R是HSA-MIR-133B和XIST的LNCRNA的目标,并且PART1也可以是HSA-MIR-133B的目标。虽然在细胞骨架,细胞骨架部分和微管骨架的GO条款中富集了上调的次数,但下调的可在免疫应答中富集。Prkaca在许多途径中明显富集,包括MAPK和胰岛素信号传导途径。
结论。IGF1R,Prkaca和LNCRNA-Xist可能涉及Pd,这些不同的分子机制可以支持Pd的类似治疗的发展。SN - 2090-8083 UR - https://doi.org/10.1155/2019/6078251 do - 10.1155 / 2019/6078251 jf - 帕金森病pb - hindawi kw - er -